Il documento contiene in dettaglio lo stato di avanzamento del Programma dal punto di vista procedurale, finanziario e fisico, le indicazioni sulle azioni di informazione, sorveglianza e controllo adottate, i risultati più significativi della sua esecuzione e, allo stesso tempo, individua le eventuali azioni da perseguire per migliorare l'efficacia dei fondi strutturali. Pertanto, va inteso sia come strumento di monitoraggio per i soggetti istituzionali deputati al controllo del Programma, sia come veicolo per informare i cittadini.

Il Rapporto annuale di Esecuzione è approvato dal Comitato di Sorveglianza e trasmesso entro il 30 giugno di ogni anno alla Commissione europea che esprime il proprio parere.  Entro il 31 marzo 2017 viene steso e trasmesso il Rapporto Finale di Esecuzione del Programma.